2008年，复旦大学拟招收硕士生约2600名(含推荐免试生)和博士研究生1085名左右(含提前攻博、硕博连读、直接攻博和公开招考人数)，录取时将视生源状况和学校发展需要适当调整招生名额。
复旦大学在招生简章中注明，为进一步改革和完善研究生教育过程中的激励机制，全面提高研究生培养质量，自2007年起试行研究生培养机制改革，在现有国家拨款的基础上，进一步加大学校各方面资金的投入，建立和实施全新的奖、助学金资助体系。不过，该校在招生简章中没有公布具体的实施方案。
据了解，复旦大学博士生奖学金覆盖面100%，硕士生奖学金覆盖面不低于90%，所有研究生还可申请助学金。以硕士生为例，改革后，学业等各方面表现出众的前20%学生能得到800元/月的奖助金，中间50%的学生可得到500元/月的奖助金，排名靠后的30%学生虽然没有奖励，但他们可以通过申请助教、助管等岗位，通过在岗工作考评来挣得500元/月的助学金，满足基本生活需要。